GENIL está presidido por la Sra. VRª de Investigación y Política Científica y sus órganos de gestión son:

• El Coordinador, responsable del proyecto y encargado de impulsar y coordinar la actividad derivada del proyecto.

• El Consejo de Dirección, a cargo del seguimiento y ejecución del proyecto, así como de evaluar anualmente las iniciativas tomadas y el grado de cumplimiento de los objetivos establecidos. Está compuesto por los Coordinadores de los Ejes de Actividad y los Directores de los tres Centros de Investigación que forman el Consorcio GENIL.

• El Consejo de Investigadores Principales, compuesto por el Coordinador y todos los responsables de los grupos de investigación asociados a los Centros de Investigación. Su misión es la ejecución operativa del proyecto, encargándose de hacer propuestas al Consejo de Dirección, planes de trabajo, líneas estratégicas, priorizar actividades, etc.

• El Comité Científico, compuesto por el Coordinador y 5 expertos externos.